在舰艇上，将人员按照职能编为数个部门，便于管理与作战。日本海上自卫队将舰艇部门称为科，这与岸基指挥机构科室称呼一致，科最高领导为XX长，在部门具体设置上与主流有较多不同。

这是日本余手级登陆艇，排水量420吨，主要用于离岛的运输补给，日方称之为“输送艇”，倒也恰如其分。这型艇的部门分别有：船务科、机电科、运用科、补给科，合计4个科。其中，船务科最杂，有航海、通信、雷达等专业。

这是燧滩级多用途支援舰，排水量950吨，主要用于训练保障，现役有5艘，舷号分别是AMS4301-05，这型舰的科设置有：船务科、航海科、补给科、机电科、运用科，合计5个科。其中，航海单独列为一个科。

这是海自碎冰舰白濑号（二代），海自唯一一艘现役碎冰舰，排水量5000吨。这型舰的科设置有：航海科、船务科、运用科、机电科、卫生科、飞行科、补给科，合计7个科。其中，多了一个特别的卫生科，主要针对北极科考任务而设置的。

综上，机电科、运用科、补给科必不可少，运用科主要负责舰上武备；大中型舰船航海、船务科分开，有直升机的设置有飞行科。由此推测，海自远洋补给舰科分为：航海科、船务科、运用科、补给科、机电科、卫生科、飞行科，同破冰舰相似。

那么，作为海自主力的驱逐舰是如何分科的呢？航海科、船务科、机电科、飞行科肯定少不了，从公开资料看，驱逐舰上设有炮雷长、应急长，说明驱逐舰上还设有炮雷科、应急科。就是繁多电子设备是放在船务科，还是另编为一个科？从遂级支援舰看，船务科有电测员，这就是雷达兵（相应的声纳兵，海自称作水测手），电子设备放在船务科可能性极大。

此外，还有个疑点就是，上述三型辅助舰艇都编有补给科，登陆艇还好理解，支援舰设置补给科则似乎不合常理。从海自将后勤人员分为经理员、补给员、给养员看，这个补给科不同于补给舰的“补给科”，应是负责舰上各项后勤事务的科，也就是常说的军需部门。

由此，基本判定海自驱逐舰编有：航海科、船务科、炮雷科、机电科、应急科、飞行科、补给科，合计7科。航海科主要负责航海保障，船务科负责通信、雷达，炮雷科负责全部武备（小型舰船为运用科），机电科负责动力，应急科负责损害管制（小型舰船由机电科兼），飞行科负责直升机飞行保障，补给科负责所有后勤工作。

这其中，最有意思的是应急科。损管有“舰艇第二生命”之称，二战中日本海军的损管表现，被认为远逊于美军。痛定思痛，战后，海自一方面获得了世界第一的扫雷能力，在舰上设置应急科，也可能与此痛彻心扉的体验有关。

这几年，海自舰艇频发火灾、碰撞等事故，仅沉船1艘——被消防水灌沉的宇久岛号扫雷艇，如此成绩相信有损管的杰出贡献。